1939（昭和14）年4月28日平沼内閣総理大臣が宮中に召され、皇后陛下（香淳皇后）から令旨を拝受し、結核の予防及び治療のために50万円のご下賜金を賜わりました。内閣は 5月１日、官民一体となって結核予防事業を遂行するため、財団法人結核予防会の創設を閣議決定しました。同年5月20日、総裁に秩父宮妃殿下を奉戴し、 5月22日設立となりました。

結核予防会各事業所の統括機能および結核に関する広報・普及啓発、結核予防事業の助成並びに資金造成、研修教育、国際協力事業などを中心に行っています。